برای نظافت و تمیز نگهداشتن مسواک رعایت چند نکته ضروری است.

۱- مسواک را قبل و بعد از استفاده زیر آب داغ آبکشی کنید. آب داغ باعث از بین رفتن میکروبها می‌شود. شستن مسواک قبل از مسواک زدن به اندازه شستن آن بعد از مسواک زدن مهم است.

۲- مسواک را در ظروف در بسته قرار ندهید زیرا رطوبت جمع شده در فضای بسته باعث رشد قارچها و باکتریها می شود. بهترین روش نگهداری مسواک در معرض هوا و در حالتی است که برس مسواک بالا و دسته آن به سمت پایین باشد.

علاوه بر این نگهداری‌ها می توان هفته ای یکبار مسواک را ضدعفونی کرد به این ترتیب که آنرا به مدت ۱۰ دقیقه در محلول دهان‌شویه آنتی باکتریال قرار دهید. در صورتی که محلول دهای‌شویه در اختیار ندارید مخلوطی از یک قسمت مایع سفید کننده (وایتکس) و دو قسمت آب در یک لیوان ریخته و مسواک را از قسمت برس به مدت ۱۰ دقیقه در آن قرار دهید. همچنین می توان آنرا به مدت ۱۵ دقیقه در فنجانی از سرکه سفید قرار دهید.

لازم به ذکر است از قرار دادن مسواک در مایکروفر و یا ماشین ظرفشویی خودداری کنید. همچنین جوشاندن مسواک علاوه بر خراب کردن مسواک، عمر آنرا نیز کم میکند.